Foire aux questions
Lors de l'installation, j'ai le message suivant: "Microsoft Defender SmartScreen a empêché le démarrage d'une application non reconnue. L'exécution de cette application peut mettre votre ordinateur en danger."
Ce message apparait car nous n'avons pas fait certifier notre application par Windows. Ce n'est pas un problème, vous pouvez installer ODIASP en cliquant sur "Informations complémentaires" > "exécuter quand même".
Quel format doivent avoir mes scanners pour être traités ?
Les scanners doivent être au format DICOM.
Je ne trouve pas mes scanners lors de l'import.
Les scanners doivent être enregistrés et placés dans un dossier à sélectionner lors de l'étape « Importer les données ». L'ordre des scanners dans le dossier n'a pas d'importance.
Que faire si je possède déjà un ensemble de coupes L3 à segmenter ?
Si l'option "Segmentation musculaire" est sélectionnée, toutes les coupes du dossier importé seront considérées comme des L3.
Puis-je traiter plusieurs scanners du même patient ?
Oui, tous les résultats seront affichés et regroupés dans la même fiche patient.
Je souhaite renseigner les tailles des patients, dois-je toutes les saisir à la main ?
Dans le tableau d'affichage des résultats, vous pouvez charger un fichier Excel contenant les tailles de vos patients (fonction « Import des tailles »). Il doit être constitué de deux colonnes:"patient name" et "height". Vous pouvez télécharger un modèle en cliquant ici.
Puis-je fermer l'application et reprendre le processus plus tard ?
Non. Si vous fermez l'application, tous les résultats non exportés seront perdus.
Je souhaite filtrer certains types de séries, est-ce possible ?
Vous pouvez ajouter des filtres associés à des types de séries à ignorer dans l'écran "Paramètres" > "filtres DICOM".
Le logiciel peut-il être utilisé dans le cadre du soin ?
Non. Le Logiciel ODIASP est un logiciel dédié à la recherche n'impliquant pas la personne humaine et ne doit pas être utilisé dans le cadre du soin.
Le logiciel peut-il être utilisé pour des finalités commerciales ?
Non. Le Logiciel ODIASP est un logiciel dédié à la recherche.
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Conditions d'utilisation
Le Logiciel ODIASP est un logiciel dédié à la recherche n'impliquant pas la personne humaine et ne doit pas être utilisé dans le cadre du soin. ODIASP est une marque déposée, l'accès au logiciel ne donne pas droit à l'utilisation du nom ODIASP autre que pour les besoins de référence associés à la diffusion du logiciel dans le cadre de la licence GNU GPLv3.
Si vous utilisez ODIASP, merci de citer les publications ci-dessous :
ODIASP: An Open User-Friendly Software for Automated SMI Determination—Application to an Inpatient Population.
medRxiv
https://doi.org/10.1101/2024.10.25.24316094
K. Charrière, A. Ragusa, B. Genoux, A. Vilotitch, S. Artemova, P.A. Beaudoin, P.E. Madiot, G. Ferretti, I. Bricault, J.L. Bosson, E. Fontaine, A. Moreau-Gaudry, J. Giai, C. Bétry
ODIASP intègre des éléments de code open source, merci de les citer également :
Population-Scale CT-Based Body Composition Analysis Of a Large Outpatient Population Using Deep Learning To Derive Age, Sex, and Race-Specific Reference Curves.
Radiology 298 (2): 319-29
https://doi.org/10.1148/radiol.2020201640
GitHub: CT Body Composition
K. Magudia, C.P. Bridge, C.P. Bay, A. Babic, F.J. Fintelmann, F. Troschel, N. Miskin, W. Wrobel, L.K. Brais, K.P. Andriole, B.M. Wolpin, M.H. Rosenthal
Fully-Automated Analysis of Body Composition from CT in Cancer Patients Using Convolutional Neural Networks.
In , 11041:204-13
https://doi.org/10.1007/978-3-030-01201-4_22
GitHub: CT Body Composition
C.P. Bridge, M. Rosenthal, B. Wright, G. Kotecha, F. Fintelmann, F. Troschel, N. Miskin, K. Desai, W. Wrobel, A. Babic, N. Khalaf, L. Brais, M. Welch, C. Zellers, N. Tenenholtz, M. Michalski, B. Wolpin, K. Andriole
Automated body composition analysis of clinically acquired computed tomography scans using neural networks.
Clinical Nutrition 39 (10): 3049-55
https://doi.org/10.1016/j.clnu.2020.01.008
M.T. Paris, P. Tandon, D.K. Heyland, H. Furberg, T. Premji, G. Low, M. Mourtzakis
ODIASP 2024